Stanoviska odborných společností ke komerčním analýzám mikrobiomu

Česká mikrobiomová společnost ČLS JEP, Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP a Společnost pro probiotika a prebiotika se důrazně vymezují vůči komerčně nabízeným analýzám střevního mikrobiomu.

Tyto služby často slibují personalizovaná doporučení v oblasti výživy, suplementace či prevence nemocí, avšak opírají se o interpretace, která neodpovídají současnému vědeckému poznání a nejsou v souladu s principy medicíny založené na důkazech (evidence-based medicine).

Přestože některé laboratoře používají kvalitní metody včetně metagenomického sekvenování (metoda, která umožňuje číst a analyzovat veškerou genetickou informaci přítomnou ve vzorku najednou, umožňuje citlivější identifikaci kmenů druhů mikroorganismů), jejich výstupy narážejí na zásadní omezení:

1. Mikrobiom je vysoce proměnlivý. Mění se v čase i v reakci na dietu, stres, nemoc či užívání léků. Jednorázový odběr nezachytí dlouhodobý stav.
2. Neexistuje definice „zdravého mikrobiomu“. Chybí referenční rozmezí, podle kterého by bylo možné výsledky jednotlivce spolehlivě posoudit.
3. Nelze určit skutečnou odchylku. Bez referenčního standardu není možné odlišit přirozenou variabilitu od patologické změny.
4. Postupy nejsou standardizované. Laboratoře používají rozdílné laboratorní a bioinformatické metody, a proto nejsou výsledky mezi firmami porovnatelné.
5. Chybí klinická interpretace. Na základě současného poznání nelze z výsledků komerčních testů spolehlivě vyvozovat závěry o zdraví ani doporučovat léčebné či dietní postupy.